近日，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院皮膚科主任栗玉珍教授團(tuán)隊(duì)在Front Immunol（IF=8.7）雜志發(fā)表題為Integrative single-cell transcriptomic investigation unveils long non-coding RNAs associated with localized cellular inflammation in psoriasis的文章。該研究提供了一個(gè)全面的健康和銀屑病條件下的全層人類皮膚的細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及LncRNA圖譜，揭示了控制銀屑病局部細(xì)胞炎癥的一種新的調(diào)控機(jī)制，并突出了LncRNA在銀屑病中的治療潛力。

栗玉珍教授帶領(lǐng)科研團(tuán)隊(duì)進(jìn)行討論

哈醫(yī)大二院皮膚科高雨歌為該論文的第一作者，哈醫(yī)大二院博士生那夢(mèng)雪為共同第一作者，哈醫(yī)大二院李超、李里、楊光宇為共同作者。哈醫(yī)大二院皮膚科栗玉珍、瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院胡益洲為共同通訊作者。

栗玉珍教授介紹，在這項(xiàng)研究中，使用了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)管道，整合了來(lái)自健康人類皮膚的106,675個(gè)細(xì)胞和來(lái)自銀屑病人類皮膚的79,887個(gè)細(xì)胞，構(gòu)建了目前世界上最大的銀屑病皮膚細(xì)胞圖譜數(shù)據(jù)集。本數(shù)據(jù)集可以進(jìn)行公開(kāi)訪問(wèn)，具有在線獲得所有細(xì)胞亞群中不同基因表達(dá)/共表達(dá)情況及數(shù)據(jù)可視化等功能。此外，本研究還率先利用整個(gè)皮膚組織的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)來(lái)精確定位在細(xì)胞水平上調(diào)節(jié)銀屑病局部炎癥的LncRNAs。分析了從銀屑病病變和健康皮膚中分離出來(lái)的單個(gè)細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組，鑒定了參與局部炎癥的新的差異表達(dá)的LncRNAs。研究為銀屑病發(fā)病機(jī)制的核心調(diào)控機(jī)制提供了新的見(jiàn)解，并強(qiáng)調(diào)了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)在識(shí)別疾病相關(guān)細(xì)胞群和分子靶點(diǎn)方面的重要角色。同時(shí)在線圖譜工具為后續(xù)皮膚細(xì)胞亞群研究人員提供便利，直觀的可視化結(jié)果對(duì)生信基礎(chǔ)較弱的臨床醫(yī)學(xué)研究人員非常友好，希望能夠助力皮膚科研。